RUKOVODILAC PROJEKTADoc. dr Irena Aranđelović (ranije Živanović)
Menadžment i integritet dizajna projekta. Realizacija istraživačkih aktivnosti i izveštavanje rezultata projektnih aktivnosti. Uspostavljanje, praćenje i održavanje saradnje sa drugim istraživačkim institucijama.
BROJ TELEFONA
+381 11 364 33 65
EMAIL ADRESA
irena.arandjelovic@med.bg.ac.rs
KARIJERA U BROJEVIMA
GODINE ISKUSTVA
NAUČNE PUBLIKACIJE
CITIRANOST
HIRSCH INDEKS
VEŠTINEO doc. dr Ireni Arandjelović
Obrazovni istraživač, kompetentna na polju teorije i istrživačkog rada u oblasti mikrobiologije, sakupljanja, obrade, analize, evaluacije i izveštavanja podataka od značaja za tip i obim istraživanja, samostalno izvodi molekularne i bioinformatičke metode, saradjuje sa nekoliko internacionalnih istraživačkih institucija.
Razumeti ponašanje patogena znači razumeti njihovu evoluciju.
Doc. dr Irena Arandjelović
RUKOVODILAC PROJEKTA
DOSTIGNUĆABiografija
Dr Aranđelović je specijalista Medicinske mikrobiologije i doktor nauka iz oblasti Molekularne medicine. Član je Nacionalne Referentne Laboratorije za tuberkulozu i koautor nacionalnog „Vodiča za mikrobiološku dijagnostiku tuberkuloze“ (3. izdanje, Beograd, 2015).
Fokus njenog istraživačkog rada su mikobakterije, primarno evolucija multirezistentnih sojeva M. tuberculosis. Od 2010. do 2015. godine učestvovala je u realizaciji nekoliko projekata Ministarstva zdravlja Republike Srbije za tuberkulozu, podržanih od strane Globalnog fonda za borbu protiv AIDS, tuberkuloze i malarije. Od 2011. godine učestvuje u realizaciji projekta „Bakterije rezistentne na antibiotike u Srbiji: fenotipska i genotipska karakterizacija“ koji finansira Ministarstvo prosvete, nauke i tehnološkog razvoja Republike Srbije.
Od 2017. godine je saradnik CRyPTIC (Comprehensive Resistance Prediction for Tuberculosis: an International Consortium) konzorcijuma. U okviru realizacije CRyPTIC projekta, finansiranog od strane Bill & Melinda Gates fondacije i Wellcome Trust/MRC Newton fonda, zadužena je za pripremu genomskih sekvenci MDR sojeva M. tuberculosis izolovanih na području Srbije za analize savremenim tehnikama bioinformatike i mašinskog učenja u cilju predikcije osetljivosti i rezistencije M. tuberculosis na antituberkulotike.
UDRUŽENJA I ČLANSTVA
Srpsko lekarsko društvo, Lekarska komora Srbije, Udruženje mikrobiologa Srbije, Federacija evropskih udruženja mikrobiologa, Nacionalna referentna laboratorija za tuberkulozu
ODABRANE PUBLIKACIJE
- Walker TM, Miotto P, Köser CU, Fowler PW, Knaggs J, Iqbal Z, Hunt M, Chindelevitch L, Farhat M, Cirillo DM, Comas I, Posey J, Omar SV, Peto TE, Suresh A, Uplekar S, Laurent S, Colman RE, Nathanson CM, Zignol M, Walker AS; CRyPTIC Consortium; Seq&Treat Consortium (Arandjelovic I), Crook DW, Ismail N, Rodwell TC. The 2021 WHO catalogue of Mycobacterium tuberculosis complex mutations associated with drug resistance: A genotypic analysis. Lancet Microbe. 2022 Apr;3(4):e265-e273.
- Yang Y, Walker TM, Kouchaki S, Wang C, Peto TEA, Crook DW, CRYPTIC Consortium (Arandjelović I), Clifton DA. An end-to-end heterogeneous graph attention network for Mycobacterium tuberculosis drug-resistance prediction. Brief Bioinform. 2021 Aug 20; bbab299; link
- Assaleh MH, Bjelogrlic SK, Prainovic N, Cvijetic I, Bozic A, Arandjelovic I, Vukovic D, Marinkovic A.
Antimycobacterial and anticancer activity of newly designed cinnamic acid hydrazides with favorable toxicity profile. Arabian Journal of Chemistry. 2021 October 30; 15: 103532; link - Wilson DJ, CRyPTIC Consortium. GenomegaMap: Within-species genome-wide dN/dS estimation from over 10,000 genomes. Mol Biol Evol 2020; 37: 2450-60; DOI: 10.1093/molbev/msaa069.
- Hunt M, Bradley P, Lapierre SG, Heys S, Thomsit M, Hall MB, Malone KM, Wintringer P, Walker TM, Cirillo DM, Comas I, Farhat MR, Fowler P, Gardy J, Ismail N, Kohl TA, Mathys V, Merker M, Niemann S, Omar SV, Sintchenko V, Smith G, van Soolingen D, Supply P, Tahseen S, Wilcox M, Arandjelovic I, Peto TEA, Crook DW, Iqbal Z. Antibiotic resistance prediction for Mycobacterium tuberculosis from genome sequence data with Mykrobe. Wellcome Open Res 2019; 4: 191. DOI: 10.12688/wellcomeopenres.15603.1.
- Arandjelović I, Merker M, Richter E, Kohl TA, Savić B, Soldatović I, Wirth T, Vuković D, Niemann S. Longitudinal outbreak of multidrug-resistant tuberculosis in a hospital setting, Serbia. Emerg Infect Dis 2019; 25: 555-58; DOI: 3201/eid2503.181220.
- Yang Y, Walker TM, Walker AS, Wilson DJ, Peto TEA, Crook DW, Shamout F, CRyPTIC consortium, Zhu T, Clifton DA. DeepAMR for predicting co-occurrent resistance of Mycobacterium tuberculosis. Bioinformatics 2019; 35: 3240-49; DOI: 10.1093/bioinformatics/btz067.
- Kouchaki S, Yang Y, Walker TM, Walker S, Wilson DJ, Peto TEA, Crook DW, CRyPTIC Consortium, Clifton DA. Application of machine learning techniques to tuberculosis drug resistance analysis. Bioinformatics 2019; 35: 2276-82; DOI: 0.1093/bioinformatics/bty949.
- Dakić I, Arandjelović I, Savić B, Jovanović S, Tošić M, Kurucin T, Vuković D. Pulmonary isolation and clinical relevance of nontuberculous mycobacteria during nationwide survey in Serbia, 2010-2015. PloS One 2018; 13: e0207751.
- CRyPTIC Consortium and the 100,000 Genomes Project, Allix-Beguec C, Arandjelovic I, Bi L, Beckert P, Bonnet M, Bradley P, Cabibbe A, Cancino-Munoz I, Caulfield MJ, Chaiprasert A, Cirillo D, Clifton D, Comas I, Crook DW, De Filippo MR, de Neeling H, Diel R, Drobniewski FA, Faksri K, Farhat MR, Fleming J, Fowler P, Fowler TA, Gao Q, Gardy J, Gascoyne-Binzi D, Gibertoni Cruz A, Gil-Brusola A, Golubchik T, Gonzalo X, Grandjean L, He G, Guthrie JL, Hoosdally S, Hunt M, Iqbal Z, Ismail N, Johnston J, Masood Khanzada F, Chuen Khor C, Kohl TA, Kong C, Lipworth S, Liu Q, Maphalala G, Martinez E, Mathys V, Merker M, Miotto P, Mistry N, Moore D, Murray M, Niemann S, Twee-Hee Ong R, A Peto TE, Posey JE, Prammananan T, Pym A, Rodrigues C, Rodrigues M, Rodwell T, Rossolini GM, Sanchez Padilla E, Schito M, Shen X, Shendure J, Sintchenko V, Sloutsky A, Smith EG, Snyder M, Soetaert K, Starks AM, Supply P, Suriyapol P, Tahseen S, Tang P, Teo YY, Nguyen Thuy Thuong T, Thwaites G, Tortoli E, Omar SV, van Soolingen D, Walker S, Walker TM, Wilcox M, Wilson DJ, Wyllie D, Yang Y, Zhang H, Zhao Y, Zhu B. Prediction of susceptibility to first-line tuberculosis drugs by DNA sequencing. N Engl J Med 2018; 379:1403-15; DOI: 1056/NEJMoa1800474.
- Šmitran A, Vuković D, Opavski N, Gajić I, Marinković J, Božić Lj, Živanović I, Kekić D, Popović S, Ranin L. Influence of subinhibitory antibiotic concentration on Streptococcus pyogenesadherence and biofilm production. Acta Microbiol Immunol Hung 2018;65:229-40.
- Miletić M, Vuković D, Živanović I, Dakić I, Soldatović I, Maletić D, Lazović S, Malović G, Petrović Z, Puač N. Inhibition of methicillin resistant Staphylococcus aureus by a plasma needle. Cent Eur J Phys 2014;12:160-7.
- Živanović I, Vuković D, Dakić I, Savić B. Species of Mycobacterium tuberculosis complex and nontuberculous mycobacteria identified in respiratory specimens from Serbia. Arch Biol Sci 2014;66:553-61.
- Živanović I, Vuković D, Dakić I, Stefanović G, Savić B. Detection of extensively drug-resistant Mycobacterium tuberculosis strains by the GenoTypeMTBDRsl assay in Serbia. Arch Biol Sci 2012;64:1311-18.
INTERNACIONALNA SARADNJA I MOBILNOST
2019 – saradnja sa Department of Applied Microbiology, Institute of Microbiology, Faculty of Biology, University of Warsaw (Dr. Tomasz Jagielski); prikupljanje izolata M. kansasii iz Srbije za genotipizaciju u cilju otkrivanja globalne prevencije novih vrsta roda Mycobacterium (ranije M. kansasii podtipovi) u kontekstu sociodemografskih i kliničkih podataka o pacijentima.
2017 – saradnja sa Nuffield Department of Medicine, University of Oxford, Oksford, Engleska (Dr. Timothy Walker); prikupljanje WGS podataka o MDR sojevima M. tuberculosis sa područja Srbije za CRyPTIC konzorcijum.
2015 jednomesečni boravak u Molecular and Experimental Mycobacteriology Group, Research Center Borstel, Borstel, Nemačka (rukovodilac Prof. Stefan Niemann) radi obuke i izvođenja bioinformatičke obrade WGS podataka za 115 MDR M. tuberculosis sojeva izolovanih u Srbiji u periodu 2008-2014. godina.
2014 tromesečni boravak u Molecular and Experimental Mycobacteriology Group, Research Center Borstel, Borstel, Nemačka (rukovodilac Prof. Stefan Niemann) radi obuke i izvođenja tehnika spoligotipizacije, MIRU-VNTR i sekvenciranja celog genoma (eng. whole genome sequencing, WGS) za 115 MDR M. tuberculosis sojeva izolovanih u Srbiji u periodu 2008-2014. godina.
STIPENDIJE I NAGRADE
FEMS (Federation of European Microbiology Societies) Research Grant 2013 za istraživanje i tipizaciju MDR sojeva M. tuberculosis primenom tehnika of spoligotipizacije, MIRU-VNTR i sekvenciranja celog genoma u Molecular and Experimental Mycobacteriology Group, Research Center Borstel, Borstel, Nemačka (3 meseca).
OBRAZOVANJE
2011 – 2018 Specijalizacija iz Medicinske mikrobiologije; Medicinski fakultet Univerziteta u Beogradu; prosečna ocena 5.0/5.0
2009 – 2015 Doktorske studije; modul Molekularna medicina; Medicinski fakultet Univerziteta u Beogradu; naziv disertacije “Vrste, filogenetske karakteristike i genetička osnova rezistencije multirezistentnih sojeva Mycobacterium tuberculosis kompleksa izolovanih u Srbiji”; prosečna ocena 10.0/10.0
2000 – 2008 Integrisane akademske studije medicine; Medicinski fakultet Univerziteta u Beogradue; prosečna ocena 9.29/10.0
